Una de las grandes desventajas de los alimentos orgánicos consiste en el escaso margen de tiempo que resisten después de ser cosechados sin perder su frescura.  Para los alimentos convencionales este no es un gran problema ya que existen productos químicos baratos que retrasan su envejecimiento post cosecha.  Pero para los orgánicos estos químicos están prohibidos.  Así, a pesar que los alimentos orgánicos obtienen precios sistemáticamente más altos que los convencionales, éste es un factor muy limitativo para el desarrollo de este mercado. Muy especialmente para productores que  se encuentren a distancias significativas de sus clientes y requieran tiempos largos de transportación.

Algunos de los productores mayores de alimentos orgánicos disponen de unidades sofisticadas de refrigeración que, a pesar de ser muy caras, no consiguen alargar mucho la preservación de sus productos. Ser reporta aquí en Science Daily que un simple tratamiento basado en el oxígeno podría resolver esta problema. Una semana de simple exposición a una atmósfera pobre en oxíegno a temperaturas de 20 grados centígrados es suficiente para prevenir el envejecimiento del 90% de las manzanas, mientras que aquellas sin este tratamiento de pierden en un 100%.  En estos momentos la técnica se está probando en otro tipo de frutas y hortalizas.